期刊简介
本刊及时向广大读者介绍国外医学微生物学，包括细菌、病毒、真菌、抗感染免疫等在临床、基础及实验检验等方面的最新动向和研究进展，供从事医学微生物学和免疫学的科研、教学、临床、检验工作者、卫生防疫以及其他从事卫生事业人员参考。
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- 杂志名称：微生物与感染杂志
- 主管单位：中华人民共和国教育部
- 主办单位：复旦大学
- 国际刊号：1673-6184
- 国内刊号：31-1966/R
- 出版周期：季刊
期刊荣誉：获卫生部《国外医学》系列评比三等奖期刊收录：万方收录(中), 统计源核心期刊(中国科技论文核心期刊), 上海图书馆馆藏, 知网收录(中), 维普收录(中), 国家图书馆馆藏
人星状病毒临床分离株感染 CaCo-2细胞的转录组分析
吴立梦；滕峥；刘晶；张曦；崔晓娴；林庆能；吴寰宇；袁政安；谢幼华
关键词：人星状病毒, 转录组测序, 转录组
摘要：人星状病毒（human astrovirus ，HAstV）是引起婴幼儿病毒性腹泻的重要病原之一，但其致病机制及与宿主相互作用的数据非常有限。本研究旨在了解HAstV感染细胞后对宿主基因在转录水平上的影响。首先，利用临床分离 HAstV毒株感染 CaCo‐2细胞，用实时定量反转录‐聚合酶链反应（reverse transcriptase‐polymerase chain reaction ，RT‐PCR）检测细胞培养上清液中的病毒总RNA ，结果显示接种后9～24 h病毒总RNA拷贝数明显增加。然后，利用转录组测序全面比较感染与未感染 HAstV的CaCo‐2细胞转录本，筛选两者间的差异表达基因；并应用KEGG信号通路富集性方法分析差异表达基因相关的信号通路。结果显示，差异基因富集在两条信号通路上（P＜0．05），分别为轴突导向通路和Ras信号通路。本研究首次利用深度测序技术分析了HAstV感染对宿主基因在转录水平上的影响，为进一步研究HAstV致病机制等提供了方向。
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