期刊简介
本刊及时向广大读者介绍国外医学微生物学，包括细菌、病毒、真菌、抗感染免疫等在临床、基础及实验检验等方面的最新动向和研究进展，供从事医学微生物学和免疫学的科研、教学、临床、检验工作者、卫生防疫以及其他从事卫生事业人员参考。
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- 杂志名称：微生物与感染杂志
- 主管单位：中华人民共和国教育部
- 主办单位：复旦大学
- 国际刊号：1673-6184
- 国内刊号：31-1966/R
- 出版周期：季刊
期刊荣誉：获卫生部《国外医学》系列评比三等奖期刊收录：万方收录(中), 统计源核心期刊(中国科技论文核心期刊), 上海图书馆馆藏, 知网收录(中), 维普收录(中), 国家图书馆馆藏
2007-2008年肠道病毒71型北京地区分离株的VP4基因序列分析
李玉运；朱汝南；钱渊；邓洁；孙宇；王芳；赵林清
关键词：肠道病毒71型, VP4基因, 手足口病, 北京
摘要：为了解2007―2008年北京地区流行的肠道病毒71型(EV71)是否存在基因序列变异及其与病毒毒力的关系,我们选择2007年分离的3株EV71(其中1株分离自重症手足口病患儿的咽拭子标本,其余2株分离自普通手足口病患儿咽拭子标本)和2008年分离的5株EV71(其中3株分离自重症手足口病患儿的咽拭子或鼻拭子标本,2株分离自普通手足口病患儿的疱疹液标本),提取基因组RNA,经反转录-聚合酶链反应(RT-PCR)扩增得到VP4基因片段,并进行核苷酸序列测定,使用生物信息软件与GenBank中的EV71 VP4基因进行序列及病毒型别分析.结果表明,所测得的8株EV71 VP4基因全长均为207 bp,编码69个氨基酸,理论相对分子质量(Mr)为7×103. 8株EV71病毒VP4基因的核苷酸同源性在94%～100%,与GenBank中其他EV71病毒株VP4的核苷酸同源性为82%～100%,与阜阳、深圳和台湾等地区流行的EV71 VP4的核苷酸同源性比其他地区高.除了与印度报道的VP4编码的氨基酸在第7和54位不同外(印度株:7位蛋氨酸,54位苏氨酸;其余株7位苏氨酸,54位丙氨酸),这8株EV71 VP4编码的氨基酸序列之间以及与其他EV71 VP4编码的氨基酸同源性均为100%.8株EV71病毒VP4与文献报道的3株重症感染病毒株VP4 (BrCr、MS和NCKU9822)核苷酸有较大差别,而8株病毒株中从重症感染(BJ97、BJ110B、BJ110Y和BJ4243)与轻症感染(BJ25、BJ47、BJ65和BJ67)分离到的毒株之间VP4基因序列未见明显改变,只有几个核苷酸存在差别.VP4核苷酸序列的进化树分析表明,这8株EV71均属于C4亚型,显示2007―2008年北京地区流行的EV71的VP4基因相当保守,分离自伴有神经系统感染的重症手足口病和普通手足口病患儿的EV71的VP4基因之间在核苷酸水平未出现同样的变异.结果提示,近2年来北京地区所流行的EV71属C4亚型.
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