期刊简介

               本刊及时向广大读者介绍国外医学微生物学,包括细菌、病毒、真菌、抗感染免疫等在临床、基础及实验检验等方面的最新动向和研究进展,供从事医学微生物学和免疫学的科研、教学、临床、检验工作者、卫生防疫以及其他从事卫生事业人员参考。                

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  • 杂志名称:微生物与感染杂志
  • 主管单位:中华人民共和国教育部
  • 主办单位:复旦大学
  • 国际刊号:1673-6184
  • 国内刊号:31-1966/R
  • 出版周期:季刊
期刊荣誉:获卫生部《国外医学》系列评比三等奖期刊收录:万方收录(中), 统计源核心期刊(中国科技论文核心期刊), 上海图书馆馆藏, 知网收录(中), 维普收录(中), 国家图书馆馆藏
微生物与感染杂志2006年第02期

乙型肝炎病毒聚合酶蛋白多态性的生物信息学分析及其意义

陈喆;朱悦;李亦学;闻玉梅

关键词:乙型肝炎病毒, 聚合酶蛋白, 多态性分析, TP域, Spacer域, RT域, RH域
摘要:目的通过Bio-HBV生物数据库,针对乙型肝炎病毒(HBV)聚合酶蛋白序列进行多态性分析.方法构建Bio-HBV生物数据库,获得国际基因序列库中所有完整的聚合酶蛋白并进行比对,采用信息熵评价序列位点的保守性,结合BLOSUM90评分系统和PAML方法,寻找选择压力下的理化性质异常的氨基酸替换模式.结果 rt266-271内频发理化性质异常的氨基酸替换,并且具有高度的统计学意义.此外,还用生物信息学的方法分析了聚合酶蛋白的TP、RT和RH功能域的保守性.结论用生物信息学验证了功能域内已知生物学特性位点的保守性,还从结构生物学出发,推测潜在的功能位点及其意义.